5-летняя магистерская программа обучения в области стоматологии предлагает три года обучения в университете, на 4-5 году обучения студенты посещают клинические занятия, которые проходят в больницах.
Студенты принимаются на основании письменного вступительного экзамена по английскому языку по следующим предметам: биология, химия и физика. Также студенты должны пройти собеседование на английском языке. Для поступления аспиранты должны набрать не менее 244 баллов из 330. С 1 по 3 курс для иностранных студентов вводится обязательный предмет чешского языка.
После завершения 5-летнего обучения по магистерской программе стоматологии выпускники будут практически и теоретически подготовлены к самостоятельной работе в области стоматологии, а также к началу обучения для получения сертификации по конкретным специальностям в стоматологии и / или в ортодонтии.